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Dexter9
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Experimentacion animal - Página 7 Empty Re: Experimentacion animal

el Vie Nov 02 2012, 11:56
NERD! escribió:Mucho radical veo por aquí. Esto apesta a demagogia barata.

Irse a comer flores, hippies!!


Podemos aportar menos criticas y mas soluciones! Wink


Me alimento con cereales! 👅
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Experimentacion animal - Página 7 Empty Re: Experimentacion animal

el Vie Nov 02 2012, 12:06
Es que tus post ya estan cargaditos de soluciones y se ve el gran manejo que tienes del tema. Asi que te tomaré la palabra y SINTIENDOLO mucho, no perderé el tiempo en esta ocasion.

P.D Casate con una rata.
Javijazz
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el Vie Nov 02 2012, 21:59
¿Podríamos decir que la falta de cariño, amor o estima hacia los animales es debido a la carencia de algún sentimiento? Es correcto no sentir "aprecio" hacia otros seres vivos que no sean los humanos? Lo podríamos comparar con la carencia de sentimiento y o remordimientos que tiene un asesino al matar? Se están alejando las personas de lo que les une con la naturaleza?
Si... Si... Si...

Un país, una civilización se puede juzgar por la forma en que trata a sus animales.

Mahatma Gandhi (1869-1948) Político y pensador indio.
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el Sáb Nov 03 2012, 01:21
Animales, animales, animales! Alguien aquí no esta cubierto de pelos??? Shocked
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el Sáb Nov 03 2012, 01:24
.





Última edición por Alberto 18 el Lun Ene 14 2013, 19:10, editado 1 vez
alodnamra
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el Sáb Nov 03 2012, 01:32
Alberto, no entres en este bucle con Dexter, yo ya lo hice en su momento y no hay manera.

Dexter, simuladores de vida, por supuesto que sí, serían la solución ideal, pero ¿con qué programas la máquina? Para diseñar el algoritmo, tendrás que saber las respuestas que el organismo ofrece ante un determinado estímulo, y luego conseguir reproducirlo todo en conjunto. ¿No crees que si fuera así de fácil diseñar "ratas virtuales", ya estaría utilizándose (bueno, se utilizan en algunas situaciones, pero sólo modelan flujos sanguíneos)? Pero las respuestas fisiológicas son complejas, múltiples, involucrando a un montón de sistemas, y ni los ordenadores pueden darnos una respuesta aceptable de momento, ni se pueden programar en algoritmos todas las variables que intervienen...
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Odiseo
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el Sáb Nov 03 2012, 02:33
No entiendo nada de lo que dicen. Llorando o muy trist
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Chinaski
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el Sáb Nov 03 2012, 03:17
También hay que decir que los seres humanos tienen una sensibilidad superior a los animales, y así como está expuesto a mayores alegrías, también lo está a mayores tristezas. Así que, aunque consideráramos que el humano es tan animal como el resto, sería más cruel experimentar con ellos que con las ratas.
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Experimentacion animal - Página 7 Empty Re: Experimentacion animal

el Sáb Nov 03 2012, 14:54
[Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] escribió:Alberto, no entres en este bucle con Dexter, yo ya lo hice en su momento y no hay manera.

Dexter, simuladores de vida, por supuesto que sí, serían la solución ideal, pero ¿con qué programas la máquina? Para diseñar el algoritmo, tendrás que saber las respuestas que el organismo ofrece ante un determinado estímulo, y luego conseguir reproducirlo todo en conjunto. ¿No crees que si fuera así de fácil diseñar "ratas virtuales", ya estaría utilizándose (bueno, se utilizan en algunas situaciones, pero sólo modelan flujos sanguíneos)? Pero las respuestas fisiológicas son complejas, múltiples, involucrando a un montón de sistemas, y ni los ordenadores pueden darnos una respuesta aceptable de momento, ni se pueden programar en algoritmos todas las variables que intervienen...

Hola Armando!

Te entiendo perfectamente, se que es bastante complejo crear un software de ese tipo ( Es algo muy adelantado para este tiempo).


[Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] escribió:No entiendo nada de lo que dicen. Llorando o muy trist

Odi

También te entiendo! :D

[Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] escribió:También hay que decir que los seres humanos tienen una sensibilidad superior a los animales, y así como está expuesto a mayores alegrías, también lo está a mayores tristezas. Así que, aunque consideráramos que el humano es tan animal como el resto, sería más cruel experimentar con ellos que con las ratas.

Chinaski solo quiero saber como se sabe que somos mas sensibles que los animales (“nuestra especie es la creadora de la tortura”).

NERD! escribió:
Animales, animales, animales! Alguien aquí no esta cubierto de pelos??? Shocked

Genial argumento... plas plas

Es que me da una rabia interna... no hay peor sordo que el que no quiere oir.

No hay peor insensible que el que carece de empatía :D

Nerd no soy un fanático, solo tenemos puntos de vista diferentes

Veo la vida así: Arroja agua al suelo y fíjate como el agua cubre todas las imperfecciones del relieve, así mismo pienso de la vida, en este caso la vida es el agua (un todo) que se adapta a su entorno.

Es tan especial y maravilloso estar vivo, es tan difícil llegar a estar vivo, es tan casual estar vivo, es tan valioso estar vivo, es tan propio estar vivo, es tan tan tan …. Que no lo puedo explicar porque no encuentro las palabras para poder expresarlo.

La vida es tan tan importante para cada ser que lo posee

Y nosotros los humanos tomamos lo que no nos pertenece, la vida de otro ser. Eso es cruel Nerd.

Concluyo diciendo lo que acostumbra a decir mi amiga Verano…

LA VIDA NO TIENE PRECIO!

[Tienes que estar registrado y conectado para ver esa imagen]


Última edición por Dexter9 el Sáb Nov 03 2012, 15:06, editado 1 vez
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el Sáb Nov 03 2012, 15:05
Tu sigue con tu demagogia y tu papanatismo, pero me niego a que taches la experimentación en animales de practica cruel y primitiva, cuando en realidad no tienes ni puta idea de lo que se hace, ni porque se hace, ni mucho menos como se hace.

Es muy sencillo decir todo lo que dices desde el sillon de tu casa y enmascarar el tufo a hipocresia y desconocimiento sobre las leyes que rigen la vida, que emana de tus palabras.

Sigue con tus ñoñerias, a ver si engañas a alguien, a mi desde luego no.

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el Sáb Nov 03 2012, 15:49
Muéstrame lo que se hace, por que se hace y como se hace?
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el Sáb Nov 03 2012, 17:00
Y Dexter, digo yo... ¿por qué la experimentación animal no, y con plantas y bacterias sí? ¿porque las ratas ponen cara de penita?

Con los animales se experimenta, vale, y precisamente en casos como la experimentación de cosméticos y productos "no vitales", yo estoy en contra también... pero lo que se hace en plantas y bacterias, desde el punto de vista ético, es mucho más bruto, agresivo y "despreciable". A la rata se le induce un tumor con objeto de investigar cómo curarlo, pero es que a las moscas y las plantas, se juega con sus genes como si fuesen piezas de lego. Y ya ni te cuento las cosas que se pueden hacer con bacterias. Pero claro, es muy bonito decir "experimentación animal no", queda muy hippy-guay aunque luego, incluso sin saberlo, te estés beneficiando diariamente de los resultados de esa investigación.
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Chinaski
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el Sáb Nov 03 2012, 19:21
Chinaski solo quiero saber como se sabe que somos mas sensibles que los animales (“nuestra especie es la creadora de la tortura”).

No creo que una rata llore años por la pérdida de un familiar, por ejemplo. Pruebas no puedo darte, pero voy a buscar y espero poder encontrar. El humano tiene un cerebro más complejo, más profundo, y eso le permite también sentir tristezas y alegrías más profundas. Igual estoy diciendo una tontería, así que voy a buscar información, aunque no se muy bien dónde. Pero sigo creyendo que disfruta y sufre más un premio nobel que una cucaracha.
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el Sáb Nov 03 2012, 19:36
Muéstrame lo que se hace, por que se hace y como se hace?

Demasiado esfuerzo para nada. Son cosas que deberias conocer antes de decir lo primero que se te pase por la cabeza. Es trabajo tuyo, yo al menos cuando hablo sobre algun tema procuro informarme previamete ,para no meter la pata o tener que recurrir a falacias argumentativas como apelar a los sentimientos. Es de muy mal gusto.

Te propongo un juego, yo te pregunto y tú me respondes lo más honestamente posible.

1-¿Cuales crees que son los objetivos de la experimentacion en animales?
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el Sáb Nov 03 2012, 20:59
NERD! escribió:
Muéstrame lo que se hace, por que se hace y como se hace?

Demasiado esfuerzo para nada. Son cosas que deberias conocer antes de decir lo primero que se te pase por la cabeza. Es trabajo tuyo, yo al menos cuando hablo sobre algun tema procuro informarme previamete ,para no meter la pata o tener que recurrir a falacias argumentativas como apelar a los sentimientos. Es de muy mal gusto.

Te propongo un juego, yo te pregunto y tú me respondes lo más honestamente posible.

1-¿Cuales crees que son los objetivos de la experimentacion en animales?

Siento intrometerme en esta bilateral discusión NERD, pero si opinas que los objetivos de la experimentación en animales es para la mejora de la raza humana, la cura de enfermedades o cualquier otra cosa similar solo decirte que vas muy equivocado; se experimenta única y solamente para augmentar los ya grandes beneficios de la industria farmacéutica, y si no es así, que se pongan a investigar la cura de enfermedades catalogadas como "minoritarias" o "raras".
Quedarias sorprendido la cantidad de barbaridades que se puede llegar a hacer con un animal, para sacar al mercado un nuevo carmín de labios para las mujeres o una crema facial anti-envejecimiento, solo tienes que buscar por internet imágenes y verás autenticas salvajadas! Es muy fácil opinar cuando no estas encerrado en una jaula del mismo tamaño que tu, con alguien tirándote ácidos, inyectándote ves a saber que substancia, mutándote genéticamente o mutilando extremidades... Eso si, siempre en nombre de la ciencia.
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el Sáb Nov 03 2012, 21:14
Dexter, no sé cómo llegas a entenderme Suspect

“El hombre ha hecho de la Tierra un infierno para los animales.” — Arthur Schopenhauer

La verdad es que el hombre es más animal que los demás animales, por decirlo así. Y no es doble moral de parte mía; yo como carne, animales, porque nací así y porque me es difícil ser vegetariano dentro de un ambiente difícil, es mi naturaleza. Experimentar con animales de manera bárbara, uff... Hacer que esos animales sufran para el bien del hombre, uff. El "mal" es consecuencia del "bien", ¿no?

Yo disfruto matando cucarachas, ratones de alcantarilla, y todos esos animalejos que me perjudican; a veces apedreo a algunos perros para espantarlos de mi casa, a donde se hacen sus necesidades, y en ocasiones por su "bendito" ladrido.

Con mamíferos, coleópteros, escarabajos, reptiles y esos otros animales que con su estructura [natural] que me deslumbran, no me meto a hacerlos sufrir, no me perjudican.
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el Sáb Nov 03 2012, 21:17
Entiendo que al ser tú un importante ejecutivo de una multinacional farmaceutica sepas de primera mano las lineas de investigación que se tratan en tus laboratorios y los protocolos seguidos en investigación con animales.... PATETICO

Es de personas inteligentes el dudar de la veracidad de las imagenes que se ven en internet y la fuente que las emite.

Muchas peliculas has visto tú, macho. Expediente X hizo mucho daño.

P.D Esto cada vez da más pena...
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el Sáb Nov 03 2012, 21:43
Tienes razón, ni soy un importante ejecutivo de una multinacional farmacéutica, ni tengo ningún laboratorio ni se los protocolos seguidos en investigación animal; Espero y deseo que para augmentar mis ínfimos conocimientos en este tema, algún día me invites tu a cualquiera de tus multinacionales y/o laboratorios para ver como seguís los protocolos de investigación, será un gran aporte a mi ya extendida ignoráncia en este tema.
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el Sáb Nov 03 2012, 21:51
Claro, asi podras cortar todas las extremidades que quieras, y si te portas bien, te dejaremos la manguera de acido, si aciertas en el ojo tiene premio!!

Ya sabes, para ganar, hay que mutar.
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el Sáb Nov 03 2012, 22:35
NERD! escribió:Claro, asi podras cortar todas las extremidades que quieras, y si te portas bien, te dejaremos la manguera de acido, si aciertas en el ojo tiene premio!!

Ya sabes, para ganar, hay que mutar.

Algún día, cuando tu impulsiva juventud no adelante a tu inteligéncia, seguiremos hablando del tema...
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el Sáb Nov 03 2012, 22:39
Las enfermedades catalogadas como raras son normalmente de origen genético; la industria farmacéutica lo único que puede hacer en ese aspecto es crear medicinas para paliar síntomas, porque si hay algo aún peor visto que la experimentación en animales es la idea de la terapia génica y tratamientos similares (para el gran público, me refiero). Y claro, encima los avances en ese área son aún más lentos, porque no sólo se trata de encontrar un fármaco útil, sino que además no interaccione con los muchos otros que un enfermo "raro" normalmente tiene que tomar.

Además, por muy malvada que se pinte siempre a la empresa farmacéutica, sus patentes caducan a los 20 años. ¿Sabes tú cuánto dinero, tiempo, esfuerzo, fuentes, trabajadores, etc, hacen falta para crear un fármaco útil? Bastante más que esos 20 años en la mayoría de los casos (ej.: cuando un fármaco antitumoral demuestra un beneficio notable, se saltan fases del estudio y se les administra a los del grupo de control, ya ha pasado alguna vez).

A mi, la verdad, por la cura definitiva del cáncer, como si hay que extinguir a las ratas de laboratorio (ratas que, por otro lado, son específicamente criadas para ese fin, no tienen cabida en el ecosistema porque nunca han formado realmente parte de él desde que se comenzaron a utilizar como animales de experimentación).
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el Sáb Nov 03 2012, 22:42
NERD! escribió:
Muéstrame lo que se hace, por que se hace y como se hace?

Demasiado esfuerzo para nada. Son cosas que deberias conocer antes de decir lo primero que se te pase por la cabeza. Es trabajo tuyo, yo al menos cuando hablo sobre algun tema procuro informarme previamete ,para no meter la pata o tener que recurrir a falacias argumentativas como apelar a los sentimientos. Es de muy mal gusto.

Te propongo un juego, yo te pregunto y tú me respondes lo más honestamente posible.

1-¿Cuales crees que son los objetivos de la experimentacion en animales?

Te sigo el juego…

1-¿Cuales crees que son los objetivos de crear un simulador de rata, reconocimiento de fármacos o simplemente un simulador médico???

2-¿De existir una “especie superior” (mas inteligente que la humana) estarías de acuerdo con la experimentación con humanos?



Anexo algunos, aunque primitivos softwares de simulación y reconocimiento de fármacos.

Por lo menos se esta haciendo el intento!.


Simulador de lesiones cerebrales traumáticas basado en modelos matemáticos de la fisiopatología del neurotrauma, presenta un neuromonitor de isquemia cerebral, imágenes ecosonográficas corporales a tiempo real y múltiples visualizaciones de parámetros de cuidado intensivo.




Biodynamica


Simula la evolución biológica de organismos portadores de hasta 20 genes diferentes. Sociodynamica: simula comportamiento de sociedades humanas en base a la visión de Adam Smith plasmada en "The Wealth of nations". Ambos simuladores son trabajos del Dr. Klaus Jaffé, Lab. de Comportamiento, Universidad Simón Bolívar




Sociodynamica


Sociodynamica: simula comportamiento de sociedades humanas en base a la visión de Adam Smith plasmada en "The Wealth of nations" Trabajo del Dr. Klaus Jaffé, Lab. de Comportamiento, Universidad Simón Bolívar.




Ventgas
(el enlace al simulador se encuentra desactivado)



Simulador de ventilación artificial y gases arteriales: se basa en un modelo matemático simplificado de la respiración humana y la dinámica cardiovascular. Simula los flujos pulmonares, intercambio de oxígeno pulmonar y tisular, así como el transporte de oxígeno por el sistema circulatorio en pacientes sometidos a ventilación mecánica con presión controlada. Corre en línea.




Rutinas de farmacocinética en Excel

Rutinas de farmacocinética en Excel elaboradas por J. Usansky, A. Desai, y D. Tang-Liu. Simulación en línea de la dinámica muscular ocular y de sus alteraciones dadas por lesión en cualquiera de los músculos extraoculares y/o pares craneanos relacionados. Incorpora respuestas pupilares.




Eye Simulations


Simulación en línea de la dinámica muscular ocular y de sus alteraciones dadas por lesión en cualquiera de los músculos extraoculares y/o pares craneanos relacionados. Incorpora respuestas pupilares.




QCP



Fisiología circulatoria cuantitativa, basado en un modelo con mas de 4.000 variables interactivas, aporta simulaciones en mas de 30 situaciones de relevancia clínica y fisiológica. Permite modificar mas de 750 parámetros en el marco de insuficiencia cardiaca, anemia, diabetes, hemorragia, circulación cerebral, presión arterial, circulación general y visceral, entre otras. Autor: Abram S, et al., Department of Physiology and Biophysics, University of Mississippi Medical Center, Jackson, Mississippi, USA. Software: Completo, con libreria de modelos, gratis, con soporte y publicaciones. Requerimientos: Windows. WEB





CVSIM

Simulador cardiovascular en línea, presenta gráficos dinámicos de presión/volumen ventricular, volumen/presión ventricular y aórtico vs tiempo, permite modificar en forma dinámica pre y postcarga, contractilidad miocárdica y frecuencia cardiaca. WEB




Rat v3.2.6


Simulación del sistema cardiovascular de la rata elaborado por John Dempster de la Universidad Strathclyde, simula en forma dinámica el experimento de espinalización de la rata con registro continuo de la presión arterial, presión del ventrículo izquierdo, presión venosa, frecuencia cardiaca, fuerza contráctil ventricular. Permite administrar mas de 22 drogas diferentes en varias dosis y definir hasta 10 nuevas drogas. Incluye estimulación nerviosa vagal, renal, adrenal, todo con o sin espinalización. Software: Completo, gratis, explicación del montaje experimental y farmacología




PLEXUS


Simulador de la actividad eléctrica del sistema neuroenterico creado por Kelly y Thomas del Enteric Neuroscience Lab, Dep.of Physiology, University of Melbourne, Australia. Modela gran cantidad de neuronas individualizadas para estudiar las propiedades básicas de la red neuronal entérica. Genera imágenes de actividad eléctrica multineuronal y su evolución en el tiempo.




QuB


Website: [Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] Programa desarrollado por la Research Foundation State University of New York, para adquirir, analizar y simular la actividad de canales iónicos de la membrana celular, posee filtrado, detecta transiciones, calcula y ajusta constantes, cinética multicanal, SKM, MIL, MPL, exporta a Excel. Trabaja con formatos .abf, .pul, .ldt, .dat, .qdf, .txt, .wav, .dwt. Maneja tarjetas National Instruments, Data Translation o cualquier tarjeta de sonido. Software: Completo, gratis, documentado con publicaciones y guía de usuario. Requerimientos: Pentium, Windows 9X,NT, 2K, (XP ¿?) .




PHA_Simulations


Simulaciones farmacológicas en línea o bajo Excel desarrollados por Hartmut Derendorf y Guenther Hochhaus: modelos de uno y dos compartimientos, IV bolus, dosis única o múltiple, metabolismo, absorción oral, PK/PD, Acción hepática y renal. Software: Completo (en línea o bajado como add-in de Excel), gratis, documentado. Requerimientos: Pentium, Windows 9X, NT, 2K, XP.




PhysioFriend


Simulador de neuronas retinianas y corticales y de sus campos receptivos. Permite simular las descargas neuronales usando la tarjeta de sonido del computador (audio monitor) de células como: fotorreceptores, horizontales, bipolares, ganglionares y corticales. El estímulo puede ser diversos patrones de orientación, contraste, tamaño en el campo visual. Software: Escrito en Java, completo, gratis, documentado con publicaciones y guía de usuario. Requerimientos: Java actualizado, Pentium, Windows, Linux o Mac.




CESLAB


Simulador de actividad eléctrica miocárdica, usa redes neurales para el cálculo de patrones del ECG, vectocardiografía, mapeo eléctrico del dorso corporal, gradientes 2D y 3D de la amplitud, latencia y repolarización de los potenciales miocárdicos normales o patológicos. Genera animaciones de alta calidad. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: sólo para Mac.




SKILLSTAT

Simulador de Electrocardiografía, presenta los 26 patrones más importantes del ECG humano. Software: Completo, gratis. Requerimientos: Pentium, Windows o Mac.




HHsim: Graphical Hodgkin-Huxley Simulator


Permite la simulación de membranas excitables usando las ecuaciones de Hodgkin-Huxley. Acceso completo a los parámetros de las ecuaciones. Escrito por D Touretzky, M Albert, N Daw, A Ladsariya de la Universidad Carnegie Mellon.




DMS Dystrophic Muscle Simulator


Presenta la evolución de las fibras musculares en la distrofia muscular, indicando mediante imagen en mosaico las fibras necróticas, regeneradas, revertidas, fibrosadas, respuesta terapéutica con administración de medicamentos en esquemas y tiempos a seleccionar, efecto del transplante de médula ósea. Producido por Garcia, L., Peltekian, E., Pastoret, C., Israeli, D., Armande, N., and Parrish, E. (1999) y publicado: "Computerised dystrophic muscle simulator: prospecting potential therapeutic strategies for muscle dystrophies using a virtual experimental model" J Gene Med, 1(1), 43-55. Corre en linea para PC, Mac y terminales X. Download posible. Escrito en Java. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Pentium, Mac o X, Java instalado.




BACSIM


Simulación del crecimiento bacteriano en las paredes de un biorreactor. Presenta la interacción entre bacterias nitrificantes, concentración de nitrógeno, producción de sustancias poliméricas extracelulares. Escrito por Jan-Ulrich Kreft del Dpto. de Biología Teórica de la Universidad de Bonn, Alemania. Software: Escrito en Java, Completo, gratis, corre en línea, documentado. Requerimientos: Pentium/, Win 95, 98, Me, 2K, NT, XP(?).




SARS OUTBREAK


Presenta la diseminación intrahospitalaria del virus del SARS, permite manejar múltiples variables, adoptar medidas terapéuticas y sanitarias para reducir la diseminación y el número de casos. Website: [Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] Software: Escrito en Java, Completo, gratis, corre en linea, documentado. Requerimientos: Pentium/, Win 95, 98, Me, 2K, NT, XP(?), MacIntosh, Linux.




XNBC


Paquete de simulación de redes neuronales biológicas. Simula, segmentos neuronales, neuronas, clústeres neuronales, redes, núcleos, sinapsis, conductancias, registros simultáneos. Las descargas son analizadas tanto convencionalmente como con métodos de procesos puntuales y series de tiempo. Website: [Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] Software: Linux, Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Pentium/, Linux, Windows 9x/2k (con Cygnust)





Bi-Direct5.zip.exe

Shunt Diagnosis.zip.exe

Qp/Qs.zip.exe

DysHb.zip.exe


Grupo de programas de simulación para Análisis fisiológico y clínico de los cortocircuitos arterio-venosos y/o intracardiacos, oximetría, cateterización, flujo sanguíneo, saturación de oxígeno, defectos septales, Qp/Qs, saturación fraccional, respiración, tratamientos. Producidos por Shepherd et al., del Dpto. de Fisiología, Universidad de Texas, San Antonio. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, Mac. WEB




Neurocirugía
de la Neuralgia
del Nervio Trigémino


Simulación basada en la Web para la inserción percutanea de una aguja para rizotomía trigeminal. Neurocirugía virtual programada en Java usando realidad virtual por Ying Li, Escuela de Computación, Universidad de Leeds, Reino Unido. Software: En línea, documentado. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, Mac




Berty002.zip


Simulador de redes neuronales con células ponderadas, muestra la actividad neuronal en tiempo real así como los trazados del EEG en los sitios seleccionados de la red. Permite aplicar estímulos en sitios elegidos, simular grandes redes a alta velocidad, resultados en 2D, células volumétricas en red 3D. Desarrollado por P. Tipping. Software: Código de máquina, Corre en DOS. Requerimientos: 80X86, Pentium, Windows 9x/2k/NT/XP (Modo DOS).




SELSIM


Simula datos de genética poblacional en los cuales se produce una selección natural en sitio único. Indica patrones de diversidad genética sugestivos de una forma particular de selección natural. Estos datos permiten detectar regiones genómicas con presiones selectivas históricas. Download: [Tienes que estar registrado y conectado para ver este vínculo] . Software: Completo, documentado con publicaciones, gratis, Requerimientos: Pentium, Windows 9x/2k/NT/XP.




IONZ


Simulador del sistema de pH corporal. Permite calcular las concentraciones de todos los componentes del sistema y estequiometría. Muy bien documentado, e-book incluido. Describe las ecuaciones. Software: Java applet copiable, corre en línea, documentado. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, Mac.




CFS


Simula la fisiología del líquido coclear, difusión de drogas y solutos en el oído interno, flujos líquidos, modelos de cóclea de humano y 6 animales, usado para el estudio del Síndrome de Meniere. Producido por A. Salt del Dpto. ORL de la Universidad de Washington. Software: Completo, gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP.




GEPASI


Permite el modelado de sistemas bioquímicos, simulando la cinética de sistemas de reacciones bioquímicas. Aporta un gran número de herramientas de ajustar modelos a data, optimizar cualquier función al modelo, realizar análisis de control metabólico y de estabilidad lineal Realiza cálculos químico/matemáticos. De precisión. Usado en investigación y docencia. Generado en el Instituto de Bioinformática del Virginia Tech, USA. Software: Completo, gratis, bien documentado, con publicaciones. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP. WEB




MCSIM


Permite programar modelos toxicológicos dinámicos, ecuaciones diferenciales, simulaciones estocásticas Monte Carlo, inferencia Bayesiana mediante simulaciones con cadenas Marcovianas. Desarrollado por Bois et al., del Instituto Nacional del Ambiente de Francia. Software: Escrito en C, programa fuente, gratis, documentado, publicaciones. Requerimientos: Compilador C para obtener ejecutables, Windows 3.X/9x/2k/NT/XP. WEB




Evolve



Simulación de vida artificial, con universo bidimensional que evoluciona según reglas definibles que incluye procesos de replicación y selección acumulativa. Generado por K Stauffer. Software: Escrito en Eiffel, completo, gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP. WEB




On-Line Pharmacokinetic Simulations


Simulador en línea o en hojas Excel, de modelos farmacocinéticos de uno o dos compartimientos, dosis oral ó IV, volumen de distribución, metabolismo, PK/PD, absorción. Producido por Ned Phillips de la Universidad de Florida. Software: Completo, gratis, bien documentado, problemas a resolver. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, explorador, Excel.





Online Cellular Systems Modelling


Potente programa de simulación metabólica capaz de incluir más de 50 enzimasy 50 factores y 50 productos simultáneamente. Los modelos de la base dedatos están agrupados en tres categorías: Célula de silicón, Modeloscentrales y Modelos demostrativos. Todos ellos documentados con lasecuaciones correspondientes. Colaboración entre las Universidades Stellenbosch (Sudáfrica) y Vrije Amsterdam (Holanda). Software: Escrito en Java, gratis, completo, on-line (con versiones para copiar). Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, explorador, Java actualizado.




PICARD


Simulador de redes neurales caóticas, mapas logísticos, auto-organización. Generado en el Instituto de Ciencias Cerebrales, Saitama, Japón. Software: Auto ejecutable. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP.




Neurological Eye Simulator


Simulador online de los movimientos oculares demostrando los efectos de lesiones individuales o múltiples de 12 músculos oculares y 6 pares craneales relacionados con el movimiento ocular. Generado en la Universidad de California (Davis). Software: Completo, documentado, basado en Macromedia, corre online. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, Mac, Explorador y Macromedia Shockwave plug-in.




CTSIM


Simulador de Tomografía Computarizada, con manejo de los parámetros físicos y sus efectos sobre la imagen, aplicación de filtros, procesamiento de la imagen, formas de visualización y de reconstrucción de la imagen. Creado bajo el concepto GNU/Linux. Software: Gratis, completo, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 2k/NT/XP, se requiere WX-Windows.




IMMSIM

Simulador del sistema inmune con capacidad de generar las interacciones entre células del sistema inmune: Células B, T, macrófagos, así como antígenos, anticuerpos, linfocinas y cualquier otro factor según las necesidades del investigador. Permite además realizar modelos de selección Clonal y respuesta humoral. Utiliza la técnica informática del autómata hipercelular. Muy útil como herramienta de investigación y docencia




AIDA


Simulador de la interacción glucosa-insulina y de la dosis de insulina-dieta en diabetes mellitus humana para fines docentes y de investigación. Simula los cambios de glicemia, glucógeno hepático, absorción intestinal de glucosa, función renal y otros parámetros como resultado de la administración de insulina y la dieta en pacientes DM-II.




ECGSIM


Excelente simulador de ECG, con representación y rotación 3D del miocardio y tórax, derivariones múltiples, vectocardiografía, mapping cardiaco y de tórax, así como del potencial de acción de fibras y regiones.




GHEMICAL
(Linux)


Software de química computacional para estudios de modelos en mecánica cuántica (semi empíricos y ab initio) y mecánica molecular, modelos reducidos de proteínas, optimización geométrica, dinámica molecular. Posee gran cantidad de herramientas de visualización. Producido por Acton, Banck, Bréfort et al. De la Universidad de Finlandia. Escrito en C++, GNU-GPL, completo, gratis, buena documentación. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP o UNIX.




Physiology Lab


Paquete con programas de simulación en fisiología que incluyen, Potencial de acción (3), músculo, Frank-Starling, huso espiral, pinza de voltaje, modelos presión-volumen, filtración capilar. Producidos por los departamentos de Fisiología de las Universidades de Tailandia y de Texas. Software: Ejecutable, completo, pequeño tamaño, fácil de usar, gratis. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP.




SNNAP


Simulator for Neural Networks and Action Potentials Versión 8. Herramienta para el rápido desarrollo, simulación y análisis de modelos realistas de neuronas y redes neuronales. Permite incluir corrientes iónicas, segundos mensajeros, flujos iónicos en modelos multicompartamentales neuronales, acoplamiento eléctrico, modulación de corrientes de membrana y transmisión sináptica inhibitoria y excitatoria. Software: Ejecutable, completo, tutoriales y documentación extensa, gratis. Requerimientos: Windows 9x/2k/NT/XP, Java, Windows, Linux, Mac.




Paquete de Simuladores


Paquete de simuladores: Starling, Nernst, Nernst y potencial de acción, Músculo, Huso muscular, Filtración capilar, Potencial de acción, Darrow-Yannet, Modelo Presión-Volumen, Sinapsis, Sistema nervioso Central, Pinza de Voltaje, Análisis de Pinza de Voltaje. Producidos por Davis, Petersen y Granger, del Dpto. de Fisiología Médica de la Universidad de Texas (TAMU).




Electrophoresis


Simulador de electroforesis de proteínas, permite correr patrones, variar el % de acrilamida y el voltaje de la corrida. Grafica migración Vs. Peso molecular, realiza estadística de bondad de ajuste. Generado por Paul Craig y Dave Mix, Dpto. de Química del Instituto de Tecnología de Rochester, USA




Java, Java Script and Other in Chemistry


Extensa recopilación de simuladores y animaciones de bioquímica y química analítica. Estequiometría, aminoácidos, ácidos nucleicos, titulación, Michaelis-Menten, equilibrio, reacciones, espectros, etc. Recopilado por B. Herrero, Dpto. de Química, Universidad del Sur de California, USA




Equilibrate


Simulador de bioquímica y biología molecular para el análisis de interacciones moleculares. Calcula gráfica y analíticamente: estado estable, equilibrio dinámico, constantes de disociación, interacción receptor-ligando, factor de transcripción-ADN y subunidades regulatorias de enzimas con subunidades catalíticas.




Cochlear Fluids Simulator


Permite el análisis de los fluidos cocleares así como de la administración y distribución de medicamentos via ventana redonda, perfusión y muestreo en perilinfa, flujo longitudinal en las tres escalas y en varios modelos animales. Generado por la Universidad de Washington.




CESLAB


Simulador electrofisiológico cardíaco, animaciones 3D a full color de activaciones y repolarizaciones, EKG de 12 derivaciones, electrogramas unipolares, vectocardiograma, mapeo de superficie, ciclo cardiaco y más.




Virtual Molecular Dynamics Laboratory Suite


Conjunto de 4 simuladores de dinámica molecular: termodinámica a gran escala (modelo Lennard-Jones), interacciones moleculares, comportamiento de partículas microscópicas, reproductor de videos moleculares, modelos simples de polímeros usando el método de IGSAW que evita la autointersección.




DMSP Radiolabeling Kinetics Simulator


Permite el cálculo de una gran cantidad de parámetros metabólicos y farmacocinéticos, vías metabólicas, concentraciones de sustratos, enzimas y productos, compartimientos, curvas cinéticas. Autor: A Hanson et al., Dpto. de Horticultura y Arquitectura Agraria, Universidad de Purdue, Indiana, USA Disponible en Visual Basic o como Java Applet (online). Requerimientos: Cualquier plataforma con acceso a internet (Java) o tener Visual Basic 5 instalado.




Population Calculator


Simulador de crecimiento poblacional con 11 parámetros de control, entre ellos número de jóvenes, maduros y ancianos, décadas a simular, tasa de nacimientos, estado estable, crecimiento lento, crecimiento Malthusiano, influencia de distribución de sexos. Autor: Francis Turner. Requerimientos: Cualquier plataforma con acceso a Internet (Java) o tener instalado Excel.




Easy Arrhythmia


Simulador de arritmias cardiacas, 25 patrones diferentes de la base de datos MIT-BIH, mapas de activación cardiacas 2D, muy documentado con textos e ilustraciones. Autor: EZ cardio software. Requerimientos: Windows 98/Me/NT(SP6)/2000/XP, Pentium III/IV. WEB




BIOSIMPC


Simulador de redes neuronales biológicas. Propiedades activas y pasivas, modelo HH. Autor: Andrick B. Universidad de Kiel, Alemania.




WinSCAMP


Metabolic Simulation and Analysis. Simulador de procesos metabólicos y redes químicas de propósito general. Utiliza un lenguaje sencillo. Incluye flujos, constantes, etc. Autor: Computational Systems Biology, Keck Graduate Institute, California Institute of Technology, U.S.A. WEB




Sim2Virus

Simulador de infección competitiva viral, incluye parámetros como tasa de infección, sobrevida viral, forma y tamaño del foco, tiempo de evolución, entre otros. Autor: A. Blumer, Computer Science, Tufts University, Medford, USA.




Karyote
CellX
RouletteCyte


Karyote : simulador de genómica, proteómica y de meta-bolismo celular. CellX : simulador de auto-organización celular. RouletteCyte : simulador celular estocástico. Autor: Centro de Teoría Viral y Celular, Universidad de Indiana, USA. Software: Completo, gratis, corre en línea (Java). Requerimientos: registro gratis.




Computer Simulation
of Metabolism


Permite la simulación de vías metabólicas definidas por el usuario con capacidad de modificar los productos intermedios marcados radioactivamente, concentraciones iniciales, tamaño de los compartimientos y tasas de producción. Autor: D. Rhodes, Dept. of Horticulture & Landscape Architecture, Purdue University, USA.




Simul 5


Permite simular movimientos iónicos en soluciones líquidas en campos eléctricos, resuelve arreglos de ecuaciones diferenciales no lineales para movimientos iónicos. Isotacoforesis, electroforesis capilar. Optimiza condiciones de separación. Autor: Grupo de procesos de separación por electromigración, Universidad Karlova, Praga, República Checa.





Enzyme - substrate conversion / velocity simulator

Calcula las relaciones entre concentraciones de enzima, sustrato y producto, temperatura, velocidad de la reacción. Autor: D Carter.




SchistoSim

Simulador de Schistosomiasis basado en el modelo descrito por Anderson and May (1985), permite evaluar el efecto de diversas estrategias de control sobre cantidad de parásitos por personas, evolución en años, epidemiología, contaminación, exposición, huésped intermediario, etc. Autor: Ch Davey, Parasitology Group, Institute of Biological Sciences, Aberystwyth University, Wales, UK.




SPATCH


Permite realizar experimentos en canales iónicos en células completas o en parches de membrana. Canales de sodio, calcio, corrientes iónicas, patrones de descarga neuronal, activación de corrientes iónicas. Simulador autosuficiente, basado en la plataforma Catacomb. Autor: R Cannon y C Hammond, Instituto Mediterráneo de Neurobiología (INMED) del Consejo Francés de Investigaciones Médicas (INSERM).




CellDesigner


Editor de diagramas estructurados que, mediante notación gráfica, permite la representación de modelos de vías bioquímicas y redes de genes regulatorios. Autor: Implementación del modelo de Kitano et al., del portal Systems Biology.org.




The
Respiratory System


Paquete modular capaz de presentar relaciones estáticas y dinámicas, trabajo respiratorio, intercambio alveolar global/individual, curvas de disociación, intercambio ambiente/tejidos, pulmón no uniforme, equilibrio ácido-base. Autores: H.I. Modell y T.W. Modell, National Science Foundation, USA. Software: Completo, múltiples módulos independientes, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 98 o superior, o emulador Windows.




Bacterial Growth


Simulador multiparamétrico de crecimiento bacteriano, muy interactivo, amigable con el usuario, resultados gráficos y analíticos de gran uso en docencia e investigación. Autor: M. Tait, Dept of Molecular & Cell Biology, Marischal College, University of Aberdeen, Reino Unido. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 98 o superior. WEB




Ethanol PD

Farmacodinámica del etanol, aplicación y cálculo de varios modelos de metabolización y varios métodos matemáticos. Autor: Holford, Universidad Auckland, New Zeland. Software: Completo, gratis, documentado, varias plataformas, Java, DOS, excel, Linux, VisualBasic, QuickBasic. Requerimientos: Windows 9X o superior. Mac OS, Linux. WEB




Organ Bath Simulator

Experimentos en asas intestinales y músculo biventer, agonistas, antagonistas, estimulación eléctrica, exporta data. Autor: Dempster J, Department of Physiology & Pharmacology, Strathclyde Institute for Biomedical Sciences, University of Strathclyde, Glasgow, UK. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X o superior. WEB




CVSim

Permite evaluación de las relaciones presión-volumen del ventrículo izquierdo. Pre -post carga, contracción ventricular, frecuencia cardiaca. Autores : Burkhoff D, Kass D, Maughan WL, División de Cardiología , The Johns Hopkins Medical Institutions, USA. Software: Multiplataforma, corre en linea , gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X o superior, Mac , Linux




POPULUS

Biología y ecología evolutiva poblacional, incluyendo: crecimiento independiente o dependiente de densidad, depredador/presa continuo, estructura demográfica y etaria , competencia Lotka - Volterra . Enfermedad microparasitaria . Salidas analíticas y gráficas. Autor : D. Alstad , Ecology, Evolution & Behavior, University of Minnesota. USA . Software: Multiplataforma, corre en línea, gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows 9X/2K/NT4.0/ME/XP, MAC OS / Linux / Unix . WEB




Human Ventricular Cell Model

Applet que simula la activación de células epi -, endo - y miocardicas humanas, usa el modelo de 17 variables de ten Tusscher , Noble, Noble y Panfilov (J Physiol 2004; 286: H1573-H1589).Calcula y grafica varios ciclos de excitación con más de 16 parámetros, corrientes iónicas, compuertas, entre otros. Software: Multiplataforma, corre en línea, gratis, documentado. Requerimientos: Conexión a internet , Windows, Mac , Linux.




JAVAPK

Programa de simulación y cálculo de farmacocinética clínica. Posee 15 medicamentos modernos entre ellos antirretrovirales . Incluye modelos: Bayesiano , Sawchuk - Zaske , Chiou . Autores: Yung - jin Lee y Jian - ming Lai , Escuela de Farmacia, Universidad Médica Kaoshiung , Taiwan . Software: Multiplataforma, gratis, documentado. Requerimientos: Conexión a internet , Windows, Mac , Linux. WEB




ACTION POTENTIAL LABORATORY

Applet en java que aplica las ecuaciones de HHK presentando el potencial de acción y las conductancias iónicas, permite variar los potenciales de equilibrio, la intensidad del estímulo y las conductancias iónicas máximas. Autores: Yidao Cai , Universidad de Texas y de Wisconsin. Software: Multiplataforma, corre en línea, gratis. Requerimientos: Conexión a Internet, Windows, Mac , Linux




DIASNET

Simulador de paciente diabético insulina dependiente, aporta los niveles plasmáticos de insulina, glucosa, tiempo, permite modificar dosis y tipo de Insulina y la dieta en composición y cantidad. Autores :Grupo de Informática Médica, Dinamarca. Software: Multiplataforma, Applet Java, gratis, documentado. Requerimientos: Conexión a internet , Windows, Mac , Linux.




Radiation Simulator

Permite desplazar electrones centrales y observar la radiación, elegir las trayectorias y verificar la radiación sincrotrón. Autores: T Shintake et al. SCSS-Proyect, Japón. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux. WEB




Diffusion Limited Aggregation

Modelo de crecimiento fractal que permite calcular el número de partículas, dirección (radio) de crecimiento, muertes, agregación y velocidad. Autores: Chi-Hang Lam, Applied Physics, Hong Kong Polytechnic University, usando el modelo de Witten y Sander. Software: Corre en línea, Java applet, completo con código fuente, gratis, documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux.





PopSize (Windows)

Compete (DOS)

PopSize permite calcular poblaciones usando el método de marca y recaptura, incluye mortalidad o migración animal marcada. Compete utiliza el modelo Lotka-Volterra de competencia intra e interespecífica. Graficos de crecimiento vs tiempo. Autor: R Gendron, Biology Department, Indiana University of Pennsylvania, USA. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows, DOS. WEB




MCELL:
A MONTE CARLO SIMULATOR OF CELLULAR MICROPHYSIOLOGY

:Simulador de metabolismo y fisiología subcelular con resultados tanto analíticos como gráficos, ofrece gran potencia y precisión, gráficos 2D/3D. Autor: MCell Team, Computational Neurobiology Lab, The Salk Institute for Biology Study, San Diego, USA. Software: Completo, multiplataforma, gratis, documentado. Requerimientos: Windows, Linux, Unix.




W3MCSim

Simulador Monte Carlo reconfigurable para modelaje interactivo, probabilístico / estadístico. Simula un modelo de ecuación repetidamente por un número dado de veces con entradas aleatorias de variables, simula experimentos, resultados estadísticos gráficos y analíticos. Basado en la publicación en Computer Methods and Programs in Biomedicine 77:71-79 de Bulis y DiStefano (UCLA, USA). Software: Completo,multiplataforma, gratis, corre en línea, documentado. Requerimientos: Windows, Linux, Unix.




QPAWN

Simulador de gobiernos, dirigentes, políticas de gobierno, economía, popularidad, índices de gestión. Formato de juego en línea con participación global, se inició en el año 1998.Software: Completo, multiplataforma, gratis, corre en línea, documentado. Requerimientos: Windows, Linux, Unix.




Stuttgart
Neural Network
Simulator

Generación, evaluación y aplicación de redes neuronales: Backpropagation, forward networks , vanilla, BP momentum term / flat spot elimination, Counterpropagation , Quickprop , Backpercolation , Rprop , RBF, ART1-2-MAP, Cascade Correlation , Recurrent Cascade Correlation , Dynamic LVQ, Backpropagation through time, Quickprop through time, Kohonen maps , TDNN, Jordan networks , Elman , Associative Memory . Desarrollado en la Universidad de Stuttgart y mantenido por la Universidad de Tübingen , Alemania. Software: JAVA, Completo, multiplataforma, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows, Linux , Unix. WEB




Nernst / Goldman
Simulator

Potenciales de difusión, equilibrio, concentraciones y permeabilidades iónicas, temperatura, gráfico y numérico. Desarrollado por M Branch y S. Wright del Colegio de Medicina, Universidad de Arizona, USA. Software: versiones autoejecutable o en linea, multiplataforma, completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows o Mac. Versión web requiere Adobe Flash Player 8.




Cell Illustrator

(Sugerido por el Prof. Antonio Fedón, UC-Ingeniería) Construcción y visualización de vías y procesos biológicos. Simulación de de procesos discretos y continuos, animaciones, diagramas de modelos, Importa modelos desde librerías KEGG, análisis y exploración de redes genéticas. Software: versiones autoejecutables o en línea, multiplataforma, completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows o Mac. Java Runtime.





QuickFlu

Usa los parámetros descritos por Longini et al. (Am. J Epidemiol. 159 (2004): 623-33) para calcular el promedio de infecciones secundarias generadas por el caso índice, visualización y cálculo rápido de las consecuencias de la aplicación de drogas antivirales como intervención ante influenza. Mantenido por M. Eichner y M. Schwehm de ExploSYS y Tübingen University Hospital, the Department for Medical Biometry (IMB). Software: Ejecutable en línea (Applet), multiplataforma, completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows o Mac. Java.




Respiration Simulator V1.0


Ventilación controlada, monitoreo de presión, flujo y volumen. Respirador controlable por 8 parámetros ( Peep , T, Tin , Freq , Tpaus , Tslop , Vt , Vm ) y paciente (pulmón) definible mediante 3 parámetros (R, C, L). Mantenido por : H Gro&#61538 ;, Berlin , Alemania. Software: Ejecutable en línea ( Applet ), multiplataforma, completo, gratis . Requerimientos: Windows o Mac . Java actualizado.





SIMTRIPLEX

Simula el comportamiento de células inmunes de ratones vacunados y naïve. Usa el modelo generalizado C-ImmSim especializado en carcinoma mamario que incluye células cancerosas, antígenos asociados al tumor, Ab, TC y NK, células vacuna con TAA, IL-12 MHCI alogénico, entre otros parámetros. Mantenido por: S Motta y F Pappalardo, Universidad de Catania, Italia. Software: Ejecutable en línea, multiplataforma, completo, gratis, requiere registro. Requerimientos: Windows o Mac. Java actualizado.





CARDIOWEB

Cálculo gráfico de las relaciones entre gasto cardiaco, presión venosa, volumen arterial, volumen auricular derecho, presión arterial, presión arterial auricular derecha, volumen venoso vs. tiempo. Con mas de 20 parámetros a definir. Software: Ejecutable en línea, multiplataforma, completo, gratis. Requerimientos: Windows o Mac.



SimSoup

El programa define tipos moleculares y posibles interacciones entre ellos, define número de moléculas, reactor, tiempo de interacción. Gráficos, redes. Software: Multiplataforma, escrito en linux, completo, gratis. Requerimientos: Windows o Mac. WEB



CC3D

Basado en los modelos de células Potts , con aplicación en morfogénesis, biofilms , cáncer, sistemas biológicos y/o físicos en general. Representaciones analíticas y gráficas 2D/3D, mapeo con escalas de pseudo color. Generado por el Instituto de Biocomplejidad , Universidad de Indiana, USA. Software: Linux, código abierto, completo, gratis. Requerimientos: Windows. WEB



CTSIM


Simula procesos de transmisión de rayos X a través de objetos fantasmas, generando proyecciones y reconstruciones de las imágenes fantasmas, mediante varios algoritmos. Posee capacidad de análisis y procesamiento de imágenes CT. Mantenido por K Rosenberg. Software: Código abierto, GNU, completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows o Linux. WEB



Abstracted Protein Simulator

Modela proteínas y sus interacciones en 3D, diseñado para estudio de los autoarreglos de proteínas de 10s hasta 100s en ventanas tiempo-espaciales mejores que otros simuladores. Análisis de densidad de receptores sinápticos, canales iónicos, citoesqueleto , formas proteínicas, sitios de unión, probabilidad de cambios de estado, entre otras funciones. Mantenido por E Grant y F Howell , University of Edinburgh , Reino Unido. Software: Código abierto, GNU, completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows o Linux/ Unix , Java. WEB



Hit Cancer

Permite evaluar el efecto de las mutaciones sobre la incidencia de cáncer poblacional. Mantenido por NIH, USA. Software: Online, Completo, gratis. Requerimientos: Windows o Linux/Unix, Flash 5.



DIZZY

Simulador estocástico de cinética química, definición de modelos Gillespie, Gibson-Bruck y Tau-Leap. Mantenido por: S Ramsey, CompBio Group, Institute for Systems Biology. USA. Software: GNU, completo, documentado, gratis. Requerimientos: Windows o Linux/Unix, Java 2. WEB



OUTBREAK


Herramienta de enseñanza interactiva de pre y postgrado sobre el procedimiento de identificación de los agentes causales de epidemias. Mantenido por: Universidad de Nuevo México, USA. Software: Corre en línea, gratis. Requerimientos: Multiplataforma usando el browser para internet .



Hemostasis SimCPB 1: Simulation of Thrombin and Fibrin Generation


Permite evaluar la regulación in vivo de la generación de trombina y fibrina antes, durante y después de un bypass cardiopulmonar. Mantenido por: Dept. of Laboratory Medicine, University of Washington. Software: Completo, muy documentado, gratis. Requerimientos: Corre en Mac . Datos para Windows disponibles en el portal. WEB



The Cardiovascular System

Permite manejar hasta 60 variables del estado cardiovascular de un paciente simulado. Administra fármacos vasoactivos, evalúa estado del paciente hasta por 10 días seguidos. Aporta resultados gráficos y analíticos (usando windig a partir de los gráficos). Mantenido por: R Min, J de Goeijen, J Sikken ( University of Twente ), y T. Coleman ( University of Mississippi ). Software: Multiplataforma, completo, documentado, gratis. Requerimientos: Java.




POTAC

Simulador de potencial de acción de axón gigante de calamar. Pinza de voltaje y de corriente, cambios de la composición iónica, bloqueo de canales de Na y/o K, ilustra el arreglo experimental, pantalla de dos canales con escalas diferentes, estimulación con doble pulso, control de la temperatura, permite grabar los experimentos, idioma castellano. Mantenido por: G Álvarez, Dpto. Fisiología y Biofísica Celular, Universidad de Sevilla, España. Software: Completo, documentado, gratis. Requerimientos: Windows 9x, 2K, XP. WEB



SpikeShaper

Permite evaluar y ajustar parámetros de modelos neuronales de compartimientos únicos del tipo H-H. construcción rápida de modelos, simulación de los efectos de cambios en las propiedades iónicas y cinéticas en patrones de potenciales de acción introducidos al programa. Mantenido por : W Heitler , School of Biology , University of St Andrews, Escocia. Software: Completo, documentado, con tutoriales , gratis. Requerimientos: Windows 9x, 2K, XP. WEB



SCATLAB


Simulador de partículas y campos electromagnéticos, diagramas polar, theta, radiales, cross section, damping, depolarización, campos cercano y lejano, Lorentz, Drude, matriz T. Mantenido por: V Bazhan. Software: Completo, documentado, con tutoriales, gratis. Requerimientos: Windows 9x, 2K, XP. WEB



The Respiratory System

Once modelos que abarcan 11 áreas de la fisiología respiratoria, mecánica, respiratoria, intercambio gaseoso, relación ventilación/perfusión y equilibrio ácido / álcali. Mantenido por: H Modell y T Modell , Physiology Educational Research Consortium , Seattle y varias universidades de U.S.A . Software: Completo, documentado, con tutoriales , gratis. Requerimientos: Windows 9x, 2K, XP.



JAVA DEMOGRAPHY

Simulación poblacional humana o animal, multiparamétrica , detallada, analítica y/o gráfica, definible por el usuario. Autores: D Udovic , T Conlin y M Felt. Mantenido por: Biology Software Lab , Universidad de Oregon, USA. Software: Completo, applet , documentado, con tutoriales , gratis. Requerimientos: Multiplataforma, corre en línea como applet de Java.



Java Epidemiology

Calcula y analiza la dispersión de una enfermedad en una población determinada, maneja variables como promedio de muertes, nacimientos, tiempo de enfermedad, probabilidad de infección, incubación, portadores,
además de las características de la población afectada. Autores: D Udovic, T Conlin, M Felt. Mantenido por: Biology Software Laboratory, Universidad de Oregon. Software: Completo, gratis, applet, documentado, con tutoriales, sugerencias. Requerimientos: Multiplataforma, corre en línea como applet de Java.



GlucoSim

Modelo de reacciones químicas y procesos de transporte de la red de interacciones glucosa-insulina del cuerpo humano, incluye modelos de diabetes I y II, basado en las propuestas de Puckett, 1992; Cobelli 1983; Bergman, 1973; Leaning 1991. Autor: A Cinar, Dept. of Chemical and Environmental Engineering, Illinois Institute of Technology , USA . Software: Completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Multiplataforma, corre en línea como applet de Java.



Ventilation / Perfusion
Distributions and Gas Exchange

Distribución de la ventilación fraccional, V/Q pulmonar, composición de la sangre venosa, FiO2 , Consumo de O2 , producción de CO2 , gasto cardiaco, ventilación minuto. Autor : K Kapitan , Southern Illinois University , School of Medicine , USA . Software: Completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Multiplataforma, corre en línea como applet de Java.



Músculo Estriado

Contracción en el músculo estriado, isotónica, isométrica, curva estiramiento-fuerza, treppe , tétanos, tiempo de contracción y relajación. Graba los experimentos creando una biblioteca. Autor: J Domínguez, A Gascueña , P de la Villa, J Ceballos . Dpto. Farmacología y Fisiología, Dpto. Automática, Universidad Alcalá de Henares, España. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X, NT, 2K, XP. WEB



SimBio

Simulador de sistemas biológicos como células cardiacas, epiteliales, pancreaticas , y similares. Escrito en Java y con capacidad de resolver ecuaciones diferenciales. Posee una biblioteca de modelos celulares, tutoriales y extensa documentación. Autores : N Sarai , S Matsuoka, A Noma , Department of Physiology and
Biophysics, Kyoto University Graduate School of Medicine, Kyoto, Japón. Software: Completo , gratis, documentado . Requerimientos: Java, multiplataforma.



Infection Simulator

Simula la infección de VIH y/o el uso de drogas como la cocaína en una población, así como las interacciones entre los individuos, permite simular más de una enfermedad o condición por individuo. Sus resultados son presentados en forma gráfica, Autor: sourceforge.net. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows.



CESE

Cell Electrophysiology Simulation Environment, paquete para simulación electrofisiológica en cualquier tipo de células (únicas), potenciales de acción, corrientes iónicas, efectos de concentraciones iónicas, temperatura, I-Vs, corrientes markovianas, puede usa modelos FitzHugh-Nagumo, Hodgkin-Huxley, Beeler-Reuter, Luo-Rudy Model I y II y más de 15 modelos adicionales. Los resultados son presentados en gráficos y en tablas y los exporta en varios formatos. Autor: S Missan, Biotech / Pharma Professionals Network member, Canadá. Software: Completo, gratis, documentado, librería y desarrollo de modelos. Requerimientos: Multiplataforma, Java runtime environment (JRE) version 1.5 (5.0) o superior. Corre en Windows, Linux, Solaris, MacOS X, AIX.



X-Ray Simulation

Sencillo programa de radiología clínica convencional, control del kilovoltaje, miliamperaje y tiempo de exposición, para obtener la placa radiográfica ideal. Autor: Escuela de salud Pública, University of Teesside, UK.
Software: Completo, gratis. Requerimientos: Multiplataforma, corre en línea.



Abstracted Protein Simulator

Modela interacciones de proteínas en 3D a nivel mesoscópico. Autoarreglos y operaciones de máquinas proteicas conteniendo de 10s a 100s proteínas en dominios temporales y espaciales. Capacidad en densidades sinápticas, arreglos de canales iónicos, citoesqueleto, memoria, autoarreglo viral. Permite formas de proteína, sitios de unión, probabilidad de cambios de estado. Los algoritmos se basan en técnicas Monte-Carlo. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Versiones disponibles en Linux, Windows y Mac. Winzip/Winrar. WEB



DAD (Diode Array Detector)

Macro de excel (95) para la simulación de las librerías espectrales de drogas y toxinas, tiempos de retención y espectros UV. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Excel 95, Win95 o superior, Winzip/Winrar. WEB



CANCER HIT

Permite determinar cómo afectan la rata y número de mutaciones afecta la incidencia a corto, mediano y largo plazo, de cáncer en una población. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Corre en línea.



KIDNEY SIMULATOR


Apartir de los datos de: ingesta de líquidos, flujo plasmático renal,peso,talla del paciente, permite calcular la concentración instantánea yla ratade flujo por unidad de masa de: urea, sodio, potasio, agua,glucosa, cloro y bicarbonato. Creado en el Dpto. de Bioingeniería,Universidad Rice, Texas,U.S.A. Software: Completo , gratis, documentado, Java applet.Requerimientos: Corre en línea, Java.



Program in Systems Immunology and Infectious Disease Modeling (PSIIM)

Program in Systems Immunology and Infectious Disease Modeling (PSIIM) Modelaje de moléculas y sus propiedades, complejos moleculares, transformaciones enzimáticas, compartimientos extracelulares, protocolos experimentales, dinámica de reacciones moleculares, señalización intracelular. Creado por: National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), National Institutes of Health (NIH), Department of Health and Human Services (HHS) USA. Software: Completo, gratis, con tutoriales, muy documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux.




JWS Online
Model Database

Simulador multimodelo con base de datos de modelos metabólicos, celulares, poblacionales, bioquímicos, etc. Aporta los resultados tanto gráfica como analíticamente con capacidad de exportar la data. La base de datos actual dispone con más de 8 modelos y 8 categorías diferentes. Software: Gratis, con tutoriales, muy documentado, multiplataforma, corre en línea. Requerimientos:Java, Windows, Mac, Linux.



Web-HUMAN

Modelaje de respuestas normales y patológicas cardiovasculares, respiratorias, renales, balance ácido-base, regulación de temperatura, fiebre, balance hidroelectrolítico, endocrino, neurológicas, musculares. Maneja más de 60 variables. Resultados en data y gráficos. Mantenido por la Universidad Skidmore, Florida, USA. Software: Completo, gratis, con tutoriales, muy documentado, multiplataforma, corre en línea. Requerimientos: Windows, Mac, Linux.



Calcium Ion Selective Electrode Simulation

Simulación de mediciones de concentración de Calcio por electrodos selectivos a iones, usa el método de la adición estándar. Generado en la Universidad de Maryland, USA. Software: Gratis, con tutoriales, muy documentado, vínculos de interés. Requerimientos: Windows 98, 2K, XP, Vista, Mac. WEB



COMPUCELL3D

Modelaje 2D/3D de morfogénesis y procesos de desarrollo embrionario, diferenciación de grupos celulares a órganos. Software: Gratis, con tutoriales, muy documentado, vínculos de interés. Requerimientos: Linux, MacOS. WEB



TRANSCRANIAL DOPPLER (TCD)

Modelo de hemodinámica cerebral, Doppler y monitoreo cerebral. Software: Versión básica gratis, documentado con publicaciones. Requerimientos: Windows XP y Vista. WEB



SIMMUNE

Paquete inmunológico constituido por tres componentes: a) Modelador: moléculas y propiedades, transformaciones enzimáticas, propiedades y comportamiento celular, compartimientos extracelulares, parámetros y protocolos de simulación, complejos moleculares con propiedades e interacciones; b) Simulador: movimientos moleculares, gradientes, reacciones y dinámica molecular; c) Buscador de la red de señalización intracelular. Desarrollado por: Institute for Theoretical Physics (Uni Hamburg, Alemania), Laboratory of Immunology (National Institute of Allergy and Infectious Diseases, NIH, USA) y Program in systems immunology and infectious disease modeling, NIAID, USA. Software: Completo, gratis, muy bien documentado con publicaciones. Requerimientos: Windows, Mac, Linux. Hay que solicitar el software con un
email.



NANS: Neuron And Network Simulator

Paquete de cuatro simuladores gráficos de neuronas y redes neuronales. Se caracteriza por la facilidad de construcción de modelos por lo que constituye una herramienta muy útil en docencia e investigación. Generado en la Universidad de Harvard, USA. Software: Completo, gratis, muy bien documentado con publicaciones. Requerimientos: Windows, Mac, Linux. WEB



MEMBRANE

Simula dos compartimientos (finitos o infinitos) conectados por un canal iónico (selectivo o no). Permite definir las concentraciones del soluto (cargados o neutros) en cada compartimiento. Calcula los flujos y la diferencia de potencial vs tiempo. Producido en el Lab. Neurofisiología del Dr. Francisco Bezanilla, Universidad de Chicago, USA. Software: Completo, gratis, corre en línea, applet de Java. Requerimientos: Multiplataforma, Java.



XRS

Simulador de rayos X y radiología digital. Explora los efectos de los parámetros radiológicos sobre la calidad de la imagen. Permite ajustar distancias (fuente-muestra, muestra-detector, fuente-colimador), longitud y diámetro de colimación, tamaño del arreglo detector, representación gráfica del arreglo, área de penumbra, tipo de muestra/tejido, aplicación de energías (1 keV a 1 MeV), cálculo de los coeficientes de atenuación lineal. Importa data en formatos .txt. Producido por Engineering Research Center, Vanderbilt University, Nashville, USA, con apoyo de National Science Foundation for Bioengineering Educational Technologies. Software: Completo, gratis, muy documentado, escrito en LabView. Requerimientos: Windows. WEB



DX-ODS

Dual X-ray Osteoporosis Diagnosis Simulator Simulador radiológico para absorciometría de rayos X de energía dual (DEXA) usado para el diagnostico de osteoporosis. Con dos rayos X de diferente energía determina la densidad mineral ósea (BMD). Compara el desempeño de diferentes métodos de densimetría ósea / osteoporosis (BMD,ABMD, QCT, T-score, SD). Producido por Engineering Research Center, Vanderbilt University, Nashville, USA. Software: Completo, gratis, muy documentado, escrito en LabView. Requerimientos: Windows. WEB



Nerve Simulation

Simulación de un registro neuronal de potenciales locales y de acción, concentraciones iónicas extracelulares de sodio y potasio, estimulación en frecuencia e intensidad regulables, administración de TTX, Lidocaina o Aminopiridina a concentraciones regulables. Graba la data y las imágenes de la pantalla del osciloscopio. Ilustra el arreglo experimental. Autor: J Dempster, University of Strathclyde, UK. Software: Completo, gratis, con soporte. Requerimientos: Windows 9X, XP, Vista. WEB



CONDUCTIVITY

Mide la conductividad (mS) de soluciones seleccionadas por el usuario (8 cationes y 6 aniones, con diferentes concentraciones. Modela los iones y su movilidad en el campo eléctrico de medición. Permite grabar los resultados. Autor: Senese F, Dpto. Química, Frostburg State University, USA. Software: Completo, gratis, en Java, corre en línea, con soporte. Requerimientos: Java (multiplataforma).



VIRTUAL AUTOPSY

Presentación interactiva de 18 casos de anatomía patológica muy bien documentados con las piezas macro y microscópicas. Los casos se orientan según el criterio del usuario para llegar a un diagnóstico (correcto o errado). Posee documentación complementaria sobre anatomía y fisiología, e historia clínica del paciente. Autor: J Naylor, Dpt. Pathology, School of Medicine, University of Leicester, UK. Software: Completo, gratis, corre en línea, con soporte. Requerimientos: Multiplataforma.




POPULATION BIOLOGY

Paquete de 12 Applets en Java sobre simulaciones en genética poblacional Darwiniana: Mother-offspring transmmission, EM algorithm for ABO frequencies, Genetic drift, Natural selection, Mean fitness, Natural selection and genetic drift, Genetic drift and mutation, Genetic drift and migration, t-allele polymorphism, Response to selection in a quantitative trait, Divergence of DNA sequences, Stochastic demography. Autor: K Holsinger, Ecology and Evolutionary Biology, Univ. Connecticut,U.S.A. Software: Completo, gratis, documentado, escrito en Java, corre en línea,puede ser copiado para correr en su computador.Requerimientos: Java (multiplataforma): Windows, Linux, Mac. WEB



CellDesigner

Modelado de redes bioquímicas de genes regulatorios, representación visual de semántica bioquímica, notación gráfica comprensiva, diagramas de procesos, bases de datos, exporta data y gráficos en PDF/SVG. Autor: A Funahashi, Systems Biology Institute y Keio University, Tokyo, Japón. Software: Completo, gratis, con soporte y publicaciones. Funciona en: Windows 9X, XP, Vista. Requiere registro. WEB



Chronic Disease Cost Calculator

Impacto socioeconómico de las enfermedades crónicas. Muy documentado, posee manual técnico y de uso del software. Autor: Centro de Control y Prevención de Enfermedades, USA. Software: Completo, gratis, con soporte y publicaciones. Requerimientos: Windows 9X, XP, Vista. WEB



Simulador Cardiovascular


Función cardiovascular presentada con analíticamente y con curvas vs tiempo de actividad eléctrica, elastancias, presiones, volúmenes, stress ventricular izquierdo, flujos, derivadas y asociaciones, bucles presión/volumen. Modificación de características activas y pasivas, cambios en contractilidad, relajación, distensibilidad, acción pericárdica, valvulopatías, cardiopatías estructurales, arritmias, acción de drogas, electrolitos, maniobras e intervenciones terapéuticas, tanto en latidos eyectivos como en isovolúmicos. Autores: A Pacher y R Lombardo, Cátedra de Fisiopatología, Facultad de Ingeniería-Bioingeniería - Universidad Nacional de Entre Ríos, Paraná, Argentina. Software: Completo, gratis, muy documentado, escrito en Visual Basic. Requerimientos: Windows 3.X, 95, 98, 98SE, Me, 2000, NT, XP. WEB.



EONS 1

Herramienta gráfica para el análisis de las interacciones sinápticas. No requiere programación matemática. Canales de Calcio (N, L, T), buffers de Ca, diffusion de Ca, bombas de Ca, cinética vesicular, receptores AMPA y
NMDA, PPSE, canales de K, receptores metabotrópicos de glutamato, retículo endoplasmático, receptor IP3, intercambiadores. Autor: T W Berger y JM Bouteiller, Laboratory of Neural Engineering, University of Southern California, USA. Software: Completo, gratis, con soporte y publicaciones. Requerimientos: Multiplataforma, Java actualizado. WEB.



SISPREAD

Genera fácilmente escenarios de epidemias con más de 35 parámetros modificables. Resultados gráficos y analíticos, exportables. Autor: P Crepey, Softpedia. Software: Completo, gratis. Requerimientos: Windows. WEB



BIOGENESIS

Programa de vida artificial que simula el proceso de evolución de los organismos primordiales. Múltiples parámetros a definir: mundos, atmósfera, organismos, códigos genéticos, metabolismo. Resultados gráficos
y analíticos, poblacionales y de individuos. Autores: J Queralt, SourceForge.net. Software: Completo, con librería de organismos y sus códigos genéticos, foro de usuarios, gratis con soporte y publicaciones. Requerimientos: Java. WEB



BOOLEAN NETWORK MODELLER

Herramienta para crear modelos de sistemas orgánicos mediante metodología boorleana. Autores: J Fisher, N Pieterman, L Church, NetBSD. Software: Completo, con código fuente, documentación (tesis). Requerimientos: Win98, WinXP, Windows2000, Windows2003, Windows Vista, Windows Vista Ultimate. WEB


Última edición por Dexter9 el Sáb Nov 03 2012, 23:06, editado 1 vez
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Experimentacion animal - Página 7 Empty Re: Experimentacion animal

el Sáb Nov 03 2012, 23:02
De acuerdo chicos, me parece muy interesante vuestro debate, pero os habéis alejado completamente del tema principal del hilo.

Si quieren debatir sobre estas u otras cuestiones, agradecería que abriesen uno distinto.

Saludos y gracias por los aportes.
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Experimentacion animal - Página 7 Empty Re: Experimentacion animal

el Sáb Nov 03 2012, 23:03
Querido Dexter,

Igual me lo he saltado, pero volvemos a lo mismo: no me has dado ni un sólo programa que sea capaz de integrar la respuesta completa de un ser vivo. Has dado para todos los sistemas, pero individualmente. Hasta para ecosistemas. Pero no me has dado uno que diga qué le pasa a una rata si le inyecto X. ¿De qué me sirve saber que mi fármaco es perfecto para el sistema neuronal, si luego resulta que tiene una hepatotoxicidad mortal? ¿O que individualmente en cada sistema, resulta ideal, pero la respuesta conjunta en el primer ser vivo al que se le inyecte es un fallo multiorgánico porque había una sinergia desconocida entre los sistemas?
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Experimentacion animal - Página 7 Empty Re: Experimentacion animal

el Sáb Nov 03 2012, 23:13
Querido amigo alodnamra

Lee debajo de la pregunta numero 2 de mi último post
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